Smart Microscopy avec ZEISS ZEN

Les publications de ces dernières années révèlent l'intérêt grandissant du concept de Smart Microscopy en Biologie à travers plusieurs éléments : intégration de Big Data, de l’IA, du contrôle instrumental avancé et de l’interopérabilité logicielle. Le microscope n’est plus un simple dispositif d’imagerie : il interagit avec l'échantillon, anticipe les dérives instrumentales et adapte en temps réel les conditions d'acquisitions. 

Pour répondre à ces besoins, la Smart Microscopy utilise une gamme d’outils qui commence simplement par l’interface graphique intuitive jusqu’au contrôle entièrement scriptable via API Python. ZEISS s’est engagé depuis plusieurs années dans cette direction, afin de permettre à la communauté scientifique de :

> Concevoir des feedback loops complexes (détection–décision–action),
> Automatiser des workflows multimodaux,
> Intégrer facilement des algorithmes d’IA et des outils d’analyse externes,
> Dépasser les limites des acquisitions « statiques » classiques.

Dans ce webinaire, Julien Kissenberger, ingénieur d'applications ZEISS Microscopy, présentera les capacités Smart Microscopy du logiciel ZEN, notamment :

• La création de workflows conditionnels avancés,
• L’utilisation de ZEN et de son API Python pour piloter le microscope,
• L’intégration de modules d’analyse en ligne et de tâches automatisées.

Il sera accompagné de Carlos Galvan-Ampudia (ENS Lyon – RDP), qui illustrera ces concepts par un cas d’étude concret :

• Imagerie confocale couplée à de la « photostimulation 3D »,
• Stratégies de contrôle spatial et temporel de l’excitation,
• Impact de la Smart Microscopy sur l’exploration de processus dynamiques en biologie du développement.