Analyse d'images haut contenu pour les études de génotoxicité

La microscopie est l'outil privilégié pour étudier les mécanismes cellulaires d'induction des dommages à l'ADN ou de génotoxicité. En effet, les principaux effets de la génotoxicité, tels que les cassures double brin de l'ADN ou les micronoyaux, peuvent être facilement détectés par imagerie. Les paramètres expérimentaux permettant l'analyse des dommages causés à l'ADN sont assez complexes, et nécessitent une utilisation combinée de l'imagerie et de l'analyse des images.

Pour mener ces études de génotoxicité, et gagner en efficacité et reproductibilité, il est notamment possible de mettre en place un pipeline d’analyse personnalisé et hautement automatisé dans l'analyse d'images. La mise en place d'un flux de travail permet de répondre à 3 besoins principaux : 

• Former un modèle d'IA dédié afin de segmenter les images
• Configurer des pipelines automatisés de bout en bout
• Stocker des données en un seul endroit sur le cloud 

Les nouvelles solutions logicielles, comme ZEISS arivis, regroupe ces propriétés. En intégrant l'opérateur Cellpose, un modèle d'IA de segmentation cellulaire, il permet de traiter les images en améliorant la précision tout en réduisant la charge manuelle.

Ce court tutoriel présente comment utiliser ces nouveaux outils pour mettre en place un workflow d'analyse d'images 2D. L’objectif est d’automatiser l’analyse à grande échelle afin d'étudier les effets génotoxiques de traitements médicamenteux sur des cellules en évaluant les dommages à l’ADN suite au traitement.

Dans ce cas présenté par le Dr. Molly McQuillken, apprenez : 

• La segmentation automatisée des cellules de carcinome rénal et des dommages de l'ADN
• La quantification des effets de traitements, jusqu'à la mise à l'échelle.