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Moniteur de bureau présentant le logiciel ZEISS arivis Pro qui affiche les résultats de l'analyse des complexes de pores nucléaires provenant des données obtenues par microscopie électronique volumétrique FIB-SEM.
Logiciel

ZEISS arivis Pro

Solution pour l'analyse et la visualisation avancées d'images

Optimisez le potentiel de vos images grâce à nos puissants outils d'analyse et de visualisation d'images. Créez des pipelines d'analyse transparents en quelques clics. Traitez sans effort des ensembles de données volumineux sur des postes de travail compatibles. « Entrez dans votre échantillon » à l'aide de notre boîte à outils de VR et découvrez de nouvelles perspectives.

  • Solution « click & play » pour les flux de tâches de routine ou personnalisés
  • Possibilité de combiner différents opérateurs pour créer des pipelines flexibles
  • Compatibilité avec de nombreux formats de fichiers d'imagerie
  • Prise en charge des modèles d'IA personnalisés et open source
  • Visualisation de données volumineuses grâce à un moteur 3D alimenté par un processeur graphique (GPU)
Scientifique travaillant dans un laboratoire de microscopie et regardant un écran de bureau affichant le logiciel ZEISS arivis Pro avec les résultats d'analyse des complexes de pores nucléaires provenant des données obtenues par microscopie électronique volumétrique FIB-SEM. Deux autres scientifiques se trouvent en arrière-plan.

Des puissants outils interactifs pour créer des pipelines flexibles

ZEISS arivis Pro vous permet de créer des pipelines d'analyse et de visualisation d'images en toute simplicité pour répondre à vos interrogations inhérentes à la recherche. Exploitez les méthodes traditionnelles ou les modèles d'IA sans effort et créez des pipelines pour n'importe quelle dimension, modalité ou taille d'image, sans pour autant posséder de connaissances en programmation.

Le logiciel prend en charge et traite plus de 30 formats de fichier courants. Traitez efficacement et facilement les fichiers volumineux. Des pipelines préconfigurés et des tests standard sont disponibles pour les tâches d'analyse simples ou exigeantes. Vous pouvez également personnaliser des pipelines adaptés à vos objectifs spécifiques.

Un seul clic suffit pour reproduire votre analyse et obtenir des résultats quantitatifs cohérents. Améliorez votre productivité et obtenez des résultats reproductibles.

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Analyse subcellulaire basée sur un modèle IA d'une image FIB-SEM

Analyse subcellulaire basée sur un modèle IA d'une image FIB-SEM

Analyse subcellulaire basée sur un modèle IA d'une image FIB-SEM
Avec l'aimable autorisation d'Anna Steyer et Yannick Schwab, EMBL.
Avec l'aimable autorisation d'Anna Steyer et Yannick Schwab, EMBL.

Analyse 3D avancée

Améliorez rapidement les résultats de vos analyses d'images multidimensionnelles grâce à l'IA. Ajoutez des annotations aux coupes de votre pile Z afin d'entraîner votre modèle de segmentation et de classification d'images, puis appliquez-les à l'ensemble de données. Utilisez localement des opérateurs d'apprentissage automatique et d'apprentissage profond ou entraînez des modèles dans le cloud, puis importez-les pour former le cœur de votre pipeline ou de votre essai flexible. Visualisez les résultats en 3D et créez des vidéos pour générer un rapport d'analyse soigné en quelques clics.

Analyse d'organoïdes en 3D

Analyse d'organoïdes en 3D

Analyse d'organoïdes en 3D
Échantillon fourni avec l'aimable autorisation du laboratoire Lutholf, imagerie réalisée par Frank Vogler au centre du service client ZEISS

Analyse de contenu approfondie

La découverte de médicaments nécessite des méthodes d'analyse d'images avancées, telles que le dépistage avec vue élargie du phénotype cellulaire ou tissulaire, modulable de 2D en 4D. Entraînez un modèle d'IA à l'aide du logiciel ZEISS arivis sur le cloud ou localement, automatisez l'analyse d'images pour gagner du temps, réduire les biais humains et obtenir des résultats cohérents.

Tracking avec ZEISS arivis Pro VR

Tracking avec ZEISS arivis Pro VR

Tracking avec ZEISS arivis Pro VR
Échantillon fourni avec l'aimable autorisation du Dr Gunar Fabig de l'Université technique de Dresde, Allemagne
Échantillon fourni avec l'aimable autorisation du Dr Gunar Fabig de l'Université technique de Dresde, Allemagne

Tracking et lignage

Quantifiez la division cellulaire et les phénotypes migratoires, puis suivez les évolutions dans des ensembles d’images en 2D et 3D de différentes tailles. Utilisez ZEISS arivis Pro VR pour contrôler avec précision les pistes générées automatiquement dans un environnement de réalité virtuelle immersif. Appliquez à nouveau très facilement votre pipeline à d'autres ensembles de données.

Traçage 3D automatisé des tissus neuronaux (cerveau de souris).

Traçage 3D automatisé des tissus neuronaux (cerveau de souris).

Traçage 3D automatisé des tissus neuronaux (cerveau de souris). Avec l'aimable autorisation du Dr Steffen Burgold, ZEISS RMS Customer Center Oberkochen, Allemagne.
Avec l'aimable autorisation du Dr Steffen Burgold, ZEISS RMS Customer Center Oberkochen, Allemagne.
Avec l'aimable autorisation du Dr Steffen Burgold, ZEISS RMS Customer Center Oberkochen, Allemagne.

Neurobiologie

Déployez des algorithmes avancés pour le traçage neuronal permettant une analyse automatique et reproductible de diverses images en un seul clic. Quantifiez les neurones, les cellules gliales / microgliales, les axones et bien plus encore, même avec un faible rapport signal sur bruit (SNR). Modifiez facilement les tracés à l'aide de nos outils interactifs semi-automatiques et de réalité virtuelle. Analysez les données des expériences passées, quel que soit le format de l'image.

Poulpe âgé de 30 jours. Échantillon fourni avec l'aimable autorisation de Montserrat Coll Lladó, Jim Swoger/EMBL Barcelona et Roger Villanueva/ICM-CSIC
Poulpe âgé de 30 jours. Échantillon fourni avec l'aimable autorisation de Montserrat Coll Lladó, Jim Swoger/EMBL Barcelona et Roger Villanueva/ICM-CSIC
Poulpe âgé de 30 jours. Échantillon fourni avec l'aimable autorisation de Montserrat Coll Lladó, Jim Swoger/EMBL Barcelona et Roger Villanueva/ICM-CSIC
Poulpe âgé de 30 jours. Échantillon fourni avec l'aimable autorisation de Montserrat Coll Lladó, Jim Swoger/EMBL Barcelona et Roger Villanueva/ICM-CSIC

ZEISS arivis Pro VR Toolkit

Découvrez votre échantillon sous un nouvel angle grâce à une expérience immersive de réalité virtuelle. Oubliez le clavier et la souris ! Vous pouvez directement déplacer, faire pivoter, changer d'échelle et configurer vos données d'images numériques. Vous ferez l'expérience d'une profondeur de vue équivalente au monde réel.

  • Explorez votre échantillon en 3D
  • Observez des détails sous différents angles
  • Collaborez avec des collègues pour l'examen en direct de votre échantillon et de vos résultats
  • Bénéficiez d'une commande vocale et manuelle conviviale
  • Profitez de la relecture et de l'édition efficaces et interactives des résultats d'analyse automatique.
Convertir plus de 30 formats de fichiers image

Convertir plus de 30 formats de fichiers image

Peu importe l'instrument utilisé pour créer votre image, le format ou la taille du fichier : le convertisseur ZEISS arivis SIS convertit facilement votre fichier image dans notre format SIS (Scalable Image Storage). Ainsi, vous pouvez explorer rapidement et de manière interactive vos images avec ZEISS arivis Pro, arivis Pro VR et arivis Hub. Gagnez un temps précieux, tout en conservant l'ensemble des données pour une analyse avancée.

  • Prise en charge de la conversion de fichiers pour plus de 30 formats
  • Mise en file d'attente de plusieurs tâches d'importation et de conversion
  • Conversion par lots sans intervention
  • Interface conviviale de gestion des tâches de conversion
  • Utilisation au-delà des images de microscopie (p. ex., CT, MRI)

Points forts de la dernière version arivis Pro

Découvrez si vous pouvez bénéficier des dernières fonctionnalités disponibles avec la version la plus récente de ZEISS arivis Pro.

  • Contenu tiers bloqué

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    Prise en charge de l'analyse de plaques microtitre assistée par IA avec ZEISS arivis 4.4
    Disponible le 30 septembre 2025

    • Traitement par lot de plaques microtitre : Optimisez les pipelines d'analyse sur de multiple puits et champs grâce à la surveillance en temps réel, à une navigation fluide et au chargement direct sur arivis Hub et effectuez un traitement simultané à grande échelle.
    • Annotations assistées par IA : Accélérez l'étape d'étiquetage des objets et l'entraînement à l'apprentissage profond à l'aide de l'intelligence artificielle. Simplifiez la segmentation 3D manuelle en utilisant l'annotation de coupes en 2D assistée par IA, combinée à l'interpolation automatique.
    • Modèle Cellpose-SAM : Accédez à une segmentation biologique de niveau expert avec une fiabilité améliorée dans des conditions d'imagerie très variées : différents canaux, tailles de cellule, niveaux de bruit, résolution et flous.
    • Visualisation 4D améliorée et exportation plus rapide des vidéos : Commandes intuitives de la rotation des images, ajustement des angles de plan de coupe à l'aide de manipulations simples pour explorer des volumes sous tous les angles et mode Quick Movie permettant une création de vidéos jusqu'à 15 fois plus rapide. La prise en charge de la réalité virtuelle inclut désormais les résultats de traçage des neurones et des crêtes.
  • Tracé et segmentation des épines dendritiques sur une image microscopique de neurones
    Tracé et segmentation des épines dendritiques sur une image microscopique de neurones

    L'analyse d'image devient encore plus simple avec ZEISS arivis Pro 4.3
    du 11 mars 2025

    ZEISS arivis Pro 4.3 apporte des améliorations considérables dans les capacités d'analyse d'images. Voici un résumé des principales nouveautés.

    Améliorations fondamentales :

    • Traçage des arêtes neurales assisté par l'IA : analyse avancée de la structure neuronale grâce à la détection automatisée des arêtes neurales à l'aide de modèles d'IA entraînés au préalable et d'approches classiques
    • Mesures cellulaires améliorées pour HCA : capacités de mesure étendues permettant des ensembles de caractéristiques plus riches pour la coloration cellulaire et d'autres applications d'analyse à haut contenu (HCA)
    • Assistance CZI native : garantit la cohérence des formats sur les plateformes d'imagerie et d'analyse de ZEISS tout en rationalisant les flux de tâches grâce au traitement direct des fichiers, sans étapes de conversion intermédiaires
    Mettre fin à « l'effet pancake »
    Mettre fin à « l'effet pancake »

    Améliorations complémentaires

    • Prise en charge de nouveaux formats de fichiers : élargit la capacité d'arivis Pro à lire plusieurs formats de fichiers de microscopie, permettant de prendre en charge les installations qui utilisent différentes plateformes d'imagerie.
    • Optimisation des performances : pour l'apprentissage profond 
      • Traitement plus rapide de l'apprentissage profond pour la segmentation des instances
      • Amélioration de l'utilisation de la mémoire partagée
      • Prise en charge étendue de la segmentation des instances pour les machines virtuelles et ZEISS arivis Hub
    • Aperçu pour le formateur local en apprentissage profond : permet aux utilisateurs d'évaluer la qualité de la segmentation par plan d'un modèle entraîné, en fournissant un retour d'information immédiat sur ses performances sans nécessiter l'exécution d'un pipeline d'analyse en 3D complet.
    • Améliorations de la visualisation : l'amélioration du rendu des surfaces dans 4D Viewer permet de créer des visualisations 3D plus naturelles, ce qui profite notamment aux résultats de la segmentation des instances en éliminant l'aspect « empilé » des objets segmentés.

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    Personnalisation au premier plan de l'analyse d'image de microscopie
    du 19 juin 2024

    ZEISS arivis Pro 4.2 offre aux utilisateurs la liberté de choisir la méthode d'analyse d'image en fonction de leurs besoins.

    La nouvelle version comprend des outils améliorés pilotés par l'IA, des fonctionnalités d'analyse en 3D et la gestion de grands ensembles de données. Le logiciel apporte une flexibilité inédite pour adapter les flux de tâches d'analyse d'image de microscopie afin de répondre aux questions inhérentes à la recherche.

    Visionnez cette courte vidéo pour en savoir plus sur les dernières fonctionnalités.

    goutte-à-goutte cellpose

    goutte-à-goutte cellpose

    goutte-à-goutte cellpose

    Fonctionnalités

    Nouveautés et à noter :

    • Maillage et rendu optimisés pour un nombre illimité d'objets dans 4D Viewer 
    • Segmentation par instance (basée sur les objets) guidée par des modèles d'apprentissage profond entraînés sur ZEISS arivis Cloud
    • Segmentation des cellules et des noyaux dans les images obtenues par microscopie au moyen de l'opération Cellpose 
    • La prévisualisation de haute précision dans le pipeline d'analyse peut utiliser des données en 3D pour produire une prévisualisation plus pertinente 
    • L'analyse peut afficher directement une prévisualisation dans 4D Viewer pour les opérations de création d'objets (p. ex. Neuron Tracer) 
    • L'apprentissage automatique peut optimiser automatiquement l'ensemble des fonctionnalités utilisées (pour améliorer les performances) 
    • Amélioration de la gestion d'un très grand nombre d'objets dans la table des objets 
    • Changement complet d'identité de la marque : Le logiciel s'appelle désormais ZEISS arivis Pro

Formats de fichiers image pris en charge

    • Abberior Inspector (.obf, .msr)
    • AmiraMesh (*.am)
    • Aperio SVS (*.svs)
    • arivis Single Image Stack 3 (*.sis)
    • Format de fichier BigDataViewer (*.xml)
    • CompuServe GIF (*.gif, *.giff)
    • Fichier image DeltaVision (*.dv)
    • DICOM Directory (*.dicomdir, *.DICOMDIR)
    • Images DICOM (*.dcm)
    • Fiji/ImageJ-TIFF (*.tif, *.tiff)
    • GE InCell (*.xdce)
    • Format de fichier Hamamatsu similaire à tiff (*.ndpi)
    • High Dynamic Range Image (*.hdr)
    • Format de fichier ICS 1.0/2.0 (*.ics, *.ibs)
    • Imaris IMS (*.ims)
    • Inspector (*.obf/*.msr)
    • JPEG/JFIF (*.jpg, *.jpeg, *.jif, *.jfif, *.j, *.jpe)
    • JPEG-2000 (*.jp2, *.j2k, *.j2c)
    • Format de fichier image Leica (*.lei,*.lif)
    • Images Luxendo (enregistrées en BigDataViewer *.xml)
    • Metamorph STK (*.stk)
    • Format de fichier Mirax SliceAC (*.mrxs)
    • Molecular Devices (GE IN Carta)
    • Format de fichier image Neuroimaging Informatics Technology Initiative (*.hdr, *.nii, *.nii.gz)
    • Fichiers Nikon ND2 (*.nd2)
    • Format de fichier Olympus (*.oir, *.oib, *.oif)
    • Gestionnaire de médias Olympus (*.vsi)
    • OME-TIFF (*.tif, *.tiff)
    • OME-TIFF/FEI (*.tif, *.tiff)
    • OME-TIFF/LaVision (*.tif, *.tiff)
    • Perking Elmer PE (format PE standard, métadonnées Columbus .qptiff)
    • Portable Network Graphics (*.png)
    • Gestionnaire de médias Slidebook (.sld)
    • TIFF Tagged Image (*.tif, *.tim, *.tiff)
    • Formats de fichier TillVision (*.rbinf, *.ini)
    • Format de fichier image TrakEM2 (trakem2.xml, *.xml)
    • Gestionnaire de médias VGI/VOL
    • VG Studio Max (*.vgl)
    • Gestionnaire de médias VG Studio Images VOL (*.vol, *.vgi)
    • Format de fichier Virtual Microscopy Specimen (*.vms, *.vmu)
    • Windows Bitmap (*.bmp, *.rle, *.vga, *.rl4, *.rl8, *.sys)
    • Zeiss Axiovision ZVI (*.zvi)
    • Zeiss CZI/ZISRAW (*.czi, *.zisraw)
    • Zeiss LSM-tiff (*.lsm)
    • Yokogawa CV (*.mlf)
    • Yokogawa CPf (*.mmd)

Téléchargements

    • Image d’aperçu de ZEISS arivis

      ZEISS arivis

      Any Image Size, Many Formats, AI-Powered.

      19 MB
      Télécharger
    • Image d’aperçu de ZEISS arivis

      ZEISS arivis

      Software Maintenance Agreement Enhanced Image Analysis Productivity

      787 KB
      Télécharger
    • Image d’aperçu de ZEISS arivis Pro

      ZEISS arivis Pro

      Powerful, flexible software solution for demanding image analysis and visualization tasks

      4 MB
      Télécharger
    • Image d’aperçu de Overcoming 3D Visualization Artifacts in Deep Learning-Based Bioimage Analysis

      Overcoming 3D Visualization Artifacts in Deep Learning-Based Bioimage Analysis

      1 MB
      Télécharger

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