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Monitor de sobremesa que muestra una pantalla del software ZEISS arivis Pro con los resultados del análisis de complejos de poros nucleares a partir de datos de EM de volumen FIB-SEM.
Software

ZEISS arivis Pro

La solución para el análisis y la visualización avanzados de imágenes

Aproveche al máximo el potencial de sus imágenes con nuestras potentes herramientas de análisis de imágenes y de visualización. Cree canalizaciones analíticas sencillas con tan solo unos pocos clics. Procese fácilmente conjuntos de datos masivos en estaciones de trabajo compatibles. «Profundice en su muestra» utilizando nuestro kit de herramientas de RV para lograr una nueva perspectiva.

  • Solución para lograr una rutina o un flujo de trabajo personalizado con unos pocos clics
  • Combine diferentes operadores para lograr canales flexibles
  • Compatible con un gran número de formatos de archivo de imagen
  • Potencie sus investigaciones con ayuda de la IA sin necesidad de codificación
  • Visualice grandes cantidades de datos mediante un motor 3D con GPU
Una científica que trabaja en un laboratorio de microscopía está mirando un monitor de sobremesa que muestra una pantalla del software ZEISS arivis Pro con los resultados del análisis de complejos de poros nucleares a partir de datos de EM de volumen FIB-SEM. Se ven otros dos científicos en el fondo.

Flujos de trabajo de análisis de imágenes flexibles de principio a fin

ZEISS arivis Pro le permite automatizar el análisis de imágenes y las canalizaciones de visualización. Aproveche fácilmente los métodos tradicionales o los modelos de IA para crear canalizaciones para cualquier tamaño, dimensión o modalidad de imagen sin necesidad de codificar.

El software es compatible con más de 30 formatos de archivo comerciales. Procesa de manera eficiente y sencilla archivos de gran tamaño. Hay disponibles canales preconfigurados y análisis estándares para tareas analíticas simples y exigentes. Si lo prefiere, también puede adaptar sus canales a sus objetivos específicos.

Repetir los análisis para obtener resultados coherentes y cuantitativos solo es cuestión de un clic. Aumente la productividad y garantice resultados reproducibles.

Solicitar una demostración
Análisis subcelular basado en un modelo de IA de captura de imágenes FIB-SEM

Análisis subcelular basado en un modelo de IA de captura de imágenes FIB-SEM

Análisis subcelular basado en un modelo de IA de captura de imágenes FIB-SEM
Cortesía de Anna Steyer y Yannick Schwab, EMBL.
Cortesía de Anna Steyer y Yannick Schwab, EMBL.

Análisis 3D avanzado

Obtenga resultados rápidamente con ayuda de la IA, incluso en tareas complejas. Anote secciones en su Z-stack para entrenar su modelo de segmentación y clasificación, y aplicarlo después a todo el conjunto de datos. Utilice operadores de aprendizaje automático y aprendizaje profundo de forma local o entrene modelos en la nube y posteriormente impórtelos para crear el núcleo de su canal automatizado. Visualice resultados en·3D y cree vídeos para generar informes de análisis limpios con solo unos clics.

Análisis de organoide en 3D

Análisis de organoide en 3D

Análisis de organoide en 3D
Muestra cortesía de Lutholf Lab, captura de imágenes de Frank Vogler en el centro de clientes de ZEISS

Análisis de alto contenido

El descubrimiento de fármacos para enfermedades complejas requiere métodos de análisis de imágenes avanzados, tales como el cribado con una vista más amplia del fenotipo celular o tisular, escalable de 2D a 4D. Entrene un modelo de IA mediante el software ZEISS arivis instalado en la nube o local, y automatice el análisis de imágenes para ahorrar tiempo, reducir el sesgo humano y obtener resultados coherentes.

Seguimiento con ZEISS arivis Pro VR

Seguimiento con ZEISS arivis Pro VR

Seguimiento con ZEISS arivis Pro VR

Seguimiento y linaje

Cuantifique la división celular y los fenotipos migratorios, y haga un seguimiento de los cambios en conjuntos de imágenes en 2D y 3D de cualquier tamaño. Utilice ZEISS arivis Pro VR para corregir con precisión los seguimientos generados automáticamente en un entorno de RV inmersivo. Vuelva a aplicar fácilmente su canal a otros conjuntos de datos.

Trazado neuronal en 3D automatizado de tejido neuronal (cerebro de ratón).

Trazado neuronal en 3D automatizado de tejido neuronal (cerebro de ratón).

Trazado neuronal en 3D automatizado de tejido neuronal (cerebro de ratón). Cortesía del Dr. Steffen Burgold, ZEISS RMS Customer Center, Oberkochen, Alemania.
Cortesía del Dr. Steffen Burgold, ZEISS RMS Customer Center, Oberkochen, Alemania.
Cortesía del Dr. Steffen Burgold, ZEISS RMS Customer Center, Oberkochen, Alemania.

Neurobiología

Implemente los algoritmos de trazado neuronal más recientes para el análisis automático y replicable de diversas imágenes con un solo clic. Cuantifique neuronas, neurogliocitos/microgliocitos, axones, etc., incluso con una baja relación señal-ruido (SNR). Edite trazas fácilmente mediante nuestras herramientas semiautomáticas interactivas y de RV. Analice datos de experimentos pasados, independientemente del formato de imagen.

Muestra de pulpo visualizada y mostrada en un entorno de RV con control por voz.
Muestra de pulpo visualizada y mostrada en un entorno de RV con control por voz.

ZEISS arivis Pro VR Toolkit

Logre una nueva perspectiva de su muestra con una experiencia inmersiva de realidad virtual. Sin las limitaciones del teclado y el ratón, podrá mover, rotar, ampliar y dar forma directamente a sus datos de captura de imágenes digitales. Experimente una percepción profunda equivalente a la del mundo real.

  • Explore su muestra en 3D
  • Observe los detalles desde diferentes ángulos
  • Colabore con colegas para revisar en directo su muestra y sus resultados
  • Control manual y por voz sencillos
  • Corrección y edición eficaces e interactivas de los resultados de análisis automáticos
Convierta más de 30 formatos de imagen

Convierta más de 30 formatos de imagen

Independientemente del instrumento que utilizó para crear su imagen y del formato y del tamaño del archivo, ZEISS arivis SIS Converter convierte fácilmente su archivo de imagen a nuestro formato de almacenamiento de imagen escalable (Scalable Image Storage, SIS) que le permite explorar de manera rápida e interactiva sus imágenes con ZEISS arivis Pro, arivis Pro VR y arivis Hub. Ahorre un tiempo considerable a la vez que conserva todos los datos para realizar análisis avanzados.

  • Admite la conversión de archivos con más de 30 formatos
  • Ponga en cola varias tareas de importación y conversión
  • Conversión de lote sin supervisión
  • Interfaz de gestión de tareas de conversión de archivos muy fácil de usar
  • No solo imágenes de microscopía (p. ej., TC, RMN)

Características destacadas de la última versión de arivis Pro

Descubra si puede beneficiarse de las últimas prestaciones disponibles con la versión más reciente de ZEISS arivis Pro.

  • Espinas trazadas y segmentadas en una imagen de microscopía neuronal
    Espinas trazadas y segmentadas en una imagen de microscopía neuronal

    El análisis de imágenes avanzado ahora aún más sencillo con ZEISS arivis Pro 4.3

    ZEISS arivis Pro 4.3 mejora enormemente las capacidades del análisis de imágenes. A continuación, encontrará un resumen de las nuevas características principales.

    Mejoras principales:

    • Trazado de espinas asistido por IA: análisis avanzado de estructuras neuronales mediante la detección automatizada de espinas utilizando modelos de IA entrenados previamente y enfoques clásicos
    • Mediciones de células mejoradas para HCA: capacidad de medición optimizada que permite disponer de mejores conjuntos de funciones para marcar células y otras aplicaciones de análisis de alto contenido (HCA)
    • Compatibilidad con CZI nativo: garantiza la consistencia de formatos en todas las plataformas de captura de imágenes y análisis de ZEISS, a la vez que agiliza los flujos de trabajo mediante el procesamiento directo de archivos, sin pasos de conversión intermedios
    Supere el desafío del «Pancake effect»
    Supere el desafío del «Pancake effect»

    Mejoras adicionales

    • Compatibilidad con formatos de archivo nuevos: amplía la capacidad de arivis Pro para leer múltiples formatos de archivos de microscopía y, de este modo, la hace compatible con instalaciones que usan diferentes plataformas de captura de imágenes.
    • Optimización del rendimiento: para el aprendizaje profundo 
      • Procesamiento del aprendizaje profundo más rápido para la segmentación de casos
      • Uso optimizado de la memoria compartida
      • Mayor compatibilidad para la segmentación de casos en máquinas virtuales y ZEISS arivis Hub
    • Vista previa del entrenador de aprendizaje profundo local: permite a los usuarios evaluar la calidad de la segmentación de un modelo entrenado por planos y proporciona feedback inmediato sobre el rendimiento sin necesidad de ejecutar un flujo de trabajo de análisis 3D completo
    • Mejoras en la visualización: el renderizado de superficies mejorado en el visualizador 4D crea visualizaciones en 3D de aspecto más natural, lo que mejora especialmente los resultados de la segmentación de casos, ya que elimina el aspecto «apilado» de los objetos segmentados

  • Contenido de terceros bloqueado

    El reproductor de vídeo se ha bloqueado de acuerdo con sus ajustes de cookies. Para cambiar los ajustes y reproducir el vídeo, haga clic en el botón de abajo y acepte el uso de tecnologías de rastreo «funcionales».

    El software ZEISS arivis pone en primer plano del análisis de imágenes de microscopía los requisitos de personalización del usuario

    ZEISS arivis Pro 4.2 brinda a los usuarios la libertad de seleccionar el método de análisis de imágenes más adecuado para sus necesidades.

    La nueva versión incorpora herramientas mejoradas basadas en IA, funciones de análisis 3D y la posibilidad de manejar grandes conjuntos de datos. El software ofrece una flexibilidad sin precedentes para adaptar los flujos de trabajo de análisis de imágenes de microscopía con el fin de responder a preguntas de investigación.

    Vea este vídeo corto para saber más acerca de las funciones más recientes.

    Goteo Cellpose

    Goteo Cellpose

    Goteo Cellpose

    ¿Qué incluye?

    Novedades y aspectos relevantes:

    • Mallado y renderización optimizados para un número ilimitado de objetos en el visualizador 4D 
    • Segmentación de casos (basada en objetos) realizada a partir de modelos de aprendizaje profundo entrenados en ZEISS arivis Cloud
    • Segmentación de células y núcleos en imágenes de microscopía utilizando el modelo Cellpose 
    • La vista previa de gran precisión en el flujo de trabajo de análisis puede funcionar con datos en 3D para crear una vista previa más significativa 
    • El análisis puede mostrar directamente una vista previa en el visualizador 4D para operaciones de creación de objetos (p. ej., Neuron Tracer) 
    • El aprendizaje automático puede optimizar automáticamente el conjunto de funciones utilizadas (para mejorar el rendimiento) 
    • Manejo mejorado de grandes cantidades de objetos en la tabla de objetos 
    • Renovación de imagen finalizada: el software se denomina ahora ZEISS arivis Pro
  • Muestra de EM de criovolumen (crio-vEM)
    Muestra de EM de criovolumen (crio-vEM) facilitada por York-Dieter Stierhof, Universidad de Tubinga.

    Resumen de los cambios en arivis Vision4D 4.1.2 lanzado el 16 de noviembre de 2023

    Segmentador Cellpose:

    • Mejora: mejores controles de memoria para evitar errores internos
    • Mejora: errores y advertencias redactados de forma más comprensible
    • Mejora: mejor descripción de los modelos entrenados previamente disponible en la ayuda
    • Modificación: ahora está activado por defecto realizar tareas por capas
    • Corrección: manejo de resultados por puntos temporales distintos que el inicial (en combinación con filtros de vóxeles)
    • Corrección: normalización de datos sesgados en el valor mínimo de intensidad
    • Corrección: otras pequeñas correcciones para el segmentador Cellpose

    Importación:

    • Mejora: importación de nombres de canales para datos XDCE
    • Corrección: importar problemas para algunas series temporales ND2

    General:

    • Mejora: licencia gratuita liberada de forma más rápida para otros usuarios tras cerrar la aplicación
  • Neuroesferas detectadas con el modelo de IA entrenado previamente Cellpose.

    Neuroesferas detectadas con el modelo de IA entrenado previamente Cellpose.

    Neuroesferas detectadas con el modelo de IA entrenado previamente Cellpose.

    Neuroesferas detectadas con el modelo de IA entrenado previamente Cellpose.

    Neuroesferas detectadas con el modelo de IA entrenado previamente Cellpose.

    Resumen de las modificaciones en arivis Vision4D 4.1.1
    Lanzado el 25 de julio de 2023

    Novedades y aspectos relevantes:

    • Segmentador Cellpose: importación directa de modelos Cellpose entrenados previamente para una segmentación rápida y sencilla en el flujo de trabajo de análisis

    Análisis:

    • Novedad: operación de análisis del segmentador nativo Cellpose (no se necesita Python)
    • Novedad: exportación de un modelo creado a partir de entrenadores de aprendizaje profundo como CZANN
    • Mejora: aprendizaje profundo: mejor compatibilidad con modelos N2V de ZEISS ZEN
    • Mejora: la opción Allow Holes está activada por defecto para el segmentador con AP
    • Mejora: mejor validación de conflictos al cambiar el nombre de entrenamientos de AP
    • Corrección: casos raros en los que las posiciones de los rastros tras el análisis a escala son incorrectas
    • Corrección: posible referencia de segmento errónea para el cuerpo celular en una traza

    Visualizador 4D:

    • Mejora: el zoom automático al hacer doble clic en un objeto se puede utilizar más en el visualizador 4D
    • Corrección: a veces, las trazas (en el estilo de visualización cónica) no podían seleccionarse en el visualizador 4D

    General:

    • Novedad: se proporciona una descripción y una descarga fuera de línea para componentes opcionales en el instalador
    • Corrección: compatibilidad mejorada para importación de archivos DeltaVision (DV)
    • Corrección: la pantalla Novedades se abre de forma más fiable tras una actualización
    • Corrección: el instalador garantiza que no se han quedado archivos de las versiones Vision4D anteriores en la carpeta de instalación
    • Correcciones y mejoras pequeñas adicionales en la biblioteca arivis_dl
  • Operación de entrenamiento de AP

    Operación de entrenamiento de AP

    Operación de entrenamiento de AP

    Operación de entrenamiento de AP

    Operación de entrenamiento de AP

    Resumen de los cambios en arivis Vision4D 4.1
    Lanzado el 27 de marzo de 2023

    Novedades y aspectos relevantes:

    • Nuevo módulo opcional: arivis AI toolkit se caracteriza por tener un flujo de trabajo de aprendizaje profundo completo en Vision4D: anotación, entrenamiento y deducción
    • Varias mejoras en el flujo de trabajo de trazado
    • Wellplate Editor para asignar manualmente conjuntos de imágenes a pocillos o campos de un pocillo

    arivis AI toolkit:

    • Novedad: Módulo opcional arivis AI toolkit
    • Novedad: Panel de entrenador de aprendizaje profundo para configurar y entrenar un modelo de AP
    • Novedad: uso de Draw Tool para dibujar segmentos y anotar regiones para clases
    • Novedad: uso de anotaciones sueltas para solventar la necesidad de dibujar en cada píxel
    • Novedad: los objetos dibujados se ordenan por clases, los píxeles se asignan al superior (no es necesario recortar superposiciones)
    • Novedad: adición y reutilización de segmentos existentes para la definición de clases
    • Novedad: posible agrupación automática basada en el fondo anotado
    • Novedad: ejecución y control de procesos de entrenamiento de AP desde Vision4D
    • Novedad: apertura directa del modelo de AP entrenado en el flujo de trabajo de análisis para la deducción
    • Novedad: exportación del modelo de AP entrenado como ONNX
    • Novedad: paquete de instalador adicional para configurar un entorno completo de AP Python

    Herramientas:

    • Novedad: Draw Tool incluye un menú contextual y tiene mejor compatibilidad con los atajos de teclado
    • Novedad: Draw Tool reconoce el panel de entrenamiento de AP
    • Novedad: Draw Tool permite cambiar la clase para dibujar mediante atajos o el menú contextual (en modo de entrenador de AP)
    • Mejora: Trace Tool: conexión con un segmento de cuerpo celular
    • Mejora: Trace Tool: eliminación optimizada de rama
    • Mejora: se entienden mejor los mensajes de «unable to connect» en Trace Tool

    Análisis:

    • Novedad: se ha cambiado el nombre del «Neuron Tracer» (de la categoría Segmentación) con «Neurite Tracer»
    • Novedad: se ha cambiado el nombre del «Neuron Tracer (from Cell Body)» con «Neuron Tracer»
    • Novedad: la vista previa del Neuron Tracer muestra todas las partes del mismo color
    • Novedad: La vista previa del Neuron Tracer muestra las partes filtradas ligeramente atenuadas (en lugar de ocultarlas por completo)
    • Mejora: los marcadores de parámetro del Neuron Tracer son más precisos
    • Mejora: adición de valor umbral por defecto y advertencias de umbral en el Neuron Tracer
    • Mejora: adición de información en el Neuron Tracer
    • Corrección: si la operación de seguimiento obtuvo muchos resultados, podría suceder que no se mostraran los últimos rastros
    • Corrección: prevención de la creación de trazas (casi) vacías en el Neuron Tracer
    • Corrección: se garantiza que se muestra siempre de inmediato un marcador de progreso de previsualización

    Visualización:

    • Novedad: la visualización de los puntos de partida puede desactivarse para las trazas
    • Mejora: generación de conos optimizada para trazos en visualizador 4D
    • Mejora: si los conos para los trazos exceden la memoria, se restablece la visualización basada en líneas
    • Mejora: recordatorio del último valor utilizado de la proyección Z para la visualización de trazas en 2D
    • Corrección: problema menor con la proyección RGB en el visualizador 4D

    Manejo de datos:

    • Novedad: Wellplate Editor para asignar manualmente conjuntos de imágenes a pocillos o campos de un pocillo
    • Novedad: asignación semiautomática de conjuntos de imágenes a posiciones de pocillos o de campos en función del nombre del conjunto de imágenes (en el Wellplate Editor)
    • Novedad: escenario de importación adicional para importar pocillos como conjunto de imágenes y abrir posteriormente el Wellplate Editor (para la asignación manual)
    • Corrección: algunos datos de LaVision no se podían importar correctamente para TileSorter
    • Corrección: problemas con algunos CZI si se importan a TileSorter

    General:

    • Novedad: servicio de análisis predictivo como instalación opcional
    • Novedad: conector de servicio gRPC
    • Novedad: ZenBridge puede funcionar con el conector de servicio gRPC (de forma opcional)
    • Mejora: actualización del controlador Sentinel incluido y HASP Lib a la versión 8.5
    • Corrección: orden de clasificación en el selector de campos del navegador (para datos de la placa de pocillos)
    • Corrección: fallo poco frecuente en el cuadro de diálogo «Transform Surface»
    • Correcciones y mejoras menores adicionales

Formatos de archivo de imagen compatibles

    • Abberior Inspector (.obf, .msr)
    • AmiraMesh (*.am)
    • Aperio SVS (*.svs)
    • arivis Single Image Stack 3 (*.sis)
    • Formato de archivo BigDataViewer (*.xml)
    • CompuServe GIF (*.gif, *.giff)
    • Archivo de imagen DeltaVision (*.dv)
    • DICOM Directory (*.dicomdir, *.DICOMDIR)
    • Imagen DICOM (*.dcm)
    • Fiji/ImageJ-TIFF (*.tif, *.tiff)
    • GE InCell (*.xdce)
    • Formato de archivo Hamamatsu tiff-like (*.ndpi)
    • Imagen High Dynamic Range (*.hdr)
    • Formato de archivo ICS 1.0/2.0 (*.ics, *.ibs)
    • Imaris IMS (*.ims)
    • Inspector (*.obf/*.msr)
    • JPEG/JFIF (*.jpg, *.jpeg, *.jif, *.jfif, *.j, *.jpe)
    • JPEG-2000 (*.jp2, *.j2k, *.j2c)
    • Formato de archivo Leica Image (*.lei,*.lif)
    • Imágenes Luxendo (guardadas como BigDataViewer *.xml)
    • Metamorph STK (*.stk)
    • Formato de archivo Mirax SliceAC (*.mrxs)
    • Molecular Devices (GE IN Carta)
    • Formato de archivo de imagen de Neuroimaging Informatics Technology Initiative (*.hdr, *.nii, *.nii.gz)
    • Archivos Nikon ND2 (*.nd2)
    • Formato de archivo Olympus (*.oir, *.oib, *.oif)
    • Olympus Media Handler (*.vsi)
    • OME-TIFF (*.tif, *.tiff)
    • OME-TIFF/FEI (*.tif, *.tiff)
    • OME-TIFF/LaVision (*.tif, *.tiff)
    • Perking Elmer PE (formato PE estándar, metadatos Columbus .qptiff)
    • Portable Network Graphics (*.png)
    • Slidebook (.sld) Media Handler
    • Imagen con etiqueta TIFF (*.tif, *.tim, *.tiff)
    • Formatos de archivo TillVision (*.rbinf, *.ini)
    • Formato de archivo de imagen TrakEM2 (trakem2.xml, *.xml)
    • VGI/VOL Media Handler
    • VG Studio Max (*.vgl)
    • VG Studio Images VOL Media Handler (*.vol, *.vgi)
    • Formato de archivo Virtual Microscopy Specimen (*.vms, *.vmu)
    • Windows Bitmap (*.bmp, *.rle, *.vga, *.rl4, *.rl8, *.sys)
    • Zeiss Axiovision ZVI (*.zvi)
    • Zeiss CZI/ZISRAW (*.czi, *.zisraw)
    • Zeiss LSM-tiff (*.lsm)
    • Yokogawa CV (*.mlf)
    • Yokogawa CPf (*.mmd)

Descargas

    • Vista previa de imagen de ZEISS arivis product family information

      ZEISS arivis product family information

      ZEISS arivis software solutions for advanced image analysis
      6 MB
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    • Vista previa de imagen de ZEISS arivis

      ZEISS arivis

      Software Maintenance Agreement Enhanced Image Analysis Productivity
      787 KB
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    • Vista previa de imagen de ZEISS arivis Pro

      ZEISS arivis Pro

      Powerful, flexible software solution for demanding image analysis and visualization tasks
      4 MB
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    • Vista previa de imagen de ZEISS Solutions for Semiconductor Development, Manufacturing, and Analysis

      ZEISS Solutions for Semiconductor Development, Manufacturing, and Analysis

      Accelerating Digital Transformation and Innovation for Semiconductor Electronics
      13 MB
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    • Vista previa de imagen de Data Mining of Electron Microscopy Images

      Data Mining of Electron Microscopy Images

      Image Analysis Workflow for ZEISS arivis Hub & Pro
      1 MB
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    • Vista previa de imagen de Overcoming 3D Visualization Artifacts in Deep Learning-Based Bioimage Analysis

      Overcoming 3D Visualization Artifacts in Deep Learning-Based Bioimage Analysis

      1 MB
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    • Vista previa de imagen de Selected Life Science Research Studies with ZEISS arivis Pro

      Selected Life Science Research Studies with ZEISS arivis Pro

      1 MB
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