CZI

Le format de fichier CZI a été développé par ZEISS pour répondre spécifiquement aux exigences de l'imagerie en microscopie. Le logiciel d'imagerie ZEN enregistre dans ce format les images multidimensionnelles telles que les time lapses, les piles Z, les expériences multipositions et les lames virtuelles. CZI combine vos données d'imagerie avec toutes les métadonnées pertinentes en un seul fichier compact.

Un nombre croissant de projets et d'entreprises utilisent déjà et prennent en charge le format CZI dans leurs applications :

• OME Bio-Formats / OMERO, Fiji & ImageJ, Python (via python-bioformats ou czifle.py), CellProfiler
• Icy, KNIME, MATLAB, Visiopharm, Imaris, Da-Cons
• HS-Analysis, arivis Browser / arivis Vision4D, MicrBrightfeld, Indica Labs, Image Pro, Amira
• Definiens, microDimensions, Orbit, QuPath, digitallabware, TissueGnostics

Ces informations sont toujours disponibles, ce qui signifie que votre processus d'imagerie est toujours reproductible dans des conditions identiques, même des années plus tard. Si vous avez besoin de partager ces images avec vos collègues, notre logiciel gratuit ZEN lite leur permet de visualiser et de traiter vos images au format CZI.

Si vous souhaitez également traiter et analyser vos images CZI à l'aide d'autres logiciels, nous vous ferons parvenir la documentation interne relative au format de fichier CZI. 

Le logiciel ZEN et les postes de travail d'imagerie de microscopie ZEISS sont conçus pour fonctionner sur des plateformes Microsoft Windows 64 bits. Pour vous assister sur d'autres systèmes d'exploitation tels que Mac OS X ou Linux, ZEISS propose une documentation concernant l'interopérabilité et a également établi des coopérations avec des projets et des entreprises partenaires.

Les images créées avec le logiciel ZEN et les systèmes de microscopie ZEISS sont enregistrées dans le format de fichier CZI entièrement documenté. Si vous souhaitez afficher et traiter les données qui ont été créées dans ce format sur des plateformes non Windows, nous vous recommandons de visiter les pages d'accueil du projet ImageJ et du progiciel ImageJ Fiji basé sur ImageJ . Des fichiers d'installation précompilés de ces programmes d'imagerie open source sont disponibles pour Mac OS X et plusieurs distributions de Linux, ainsi qu'une multitude de plug-ins pour l'analyse et le traitement. L'importation des images CZI et des métadonnées est prise en charge par le plug-in Bio-Formats de l'environnement Open Microscopy.

Attention : ZEISS Microscopy ne peut fournir une quelconque assistance au niveau utilisateur pour ces applications. En revanche, ZEISS soutient des projets et des communautés de logiciels ouverts avec un accès aux développeurs, la documentation et les SDK pour les produits de microscopie sélectionnés. Si vous êtes un développeur intéressé, vous pouvez vous inscrire gratuitement pour avoir accès à la documentation CZI.