ZEISS arivis による画像解析

時短解析で研究濃度を上げる

ZEISS arivis

スケーラブルで高度な画像解析ツール

arivis とは

arivis は、高度な顕微鏡画像解析ソフトウェアツールです。多次元・大容量の画像データを扱い、可視化から解析、ワークフロー自動化、AI モデルトレーニングまでを支援します。本ツールは、画像データの「顕微鏡」「サイズ」「複雑さ」に関わらず、30種類以上のファイル形式に対して、選択された画像解析手法での画像解析を可能とします。本ツールの本質は、顕微鏡画像解析でのユーザーによるカスタマイズ性にあります。

ZEN との違い

ZEN (ZEISS Efficient Navigation)は、顕微鏡の操作・画像取得を中心に、画像の処理、可視化、解析までを支援するソフトウェアツールです。

ZEN は顕微鏡の制御・画像取得を含む幅広い顕微鏡ワークフロー、arivis は大容量・多次元画像の高度な解析とその自動化・拡張に重点を置いた製品で、これらは目的に応じて連携・使い分けることができます。たとえば、ZEN で画像を取得し、arivis Pro で詳細な解析を行う運用や、arivis Cloud で作成したAIモデルを ZEN や arivis Pro のワークフローで活用することができます。

arivis を活用できる研究・応用分野

  • 神経科学・神経生物学:神経細胞のトレース、神経組織の解析
  • 細胞生物学:細胞・核・細胞小器官などの検出、定量、形態解析
  • 発生生物学
  • オルガノイドを対象とした研究
  • 複雑なin vitroモデル(CIVMs)の研究
  • ハイコンテント解析(HCA)
  • 創薬・薬理研究:細胞・組織の表現型解析や画像ベースの評価
  • 脳・組織の3D解析
  • 細胞や粒子の動態・トラッキング、系譜解析
  • 材料科学・材料研究
  • 産業用途の画像解析
  • 電子顕微鏡画像などの大容量・高次元データ解析

*上記は活用例です。ご活用の適合性は、画像データ、解析目的・ソフトウェア構成によって異なります

研究上の課題と arivis 導入

研究現場での課題に対して arivis が支援すること

研究現場での課題

顕微鏡画像に対する課題

arivis が支援すること

画像データの大容量化、複雑化

3D・4D撮影や高解像度撮影により、ファイルサイズやデータ構造が複雑化。読み込み・表示・解析に時間がかかり、従来環境では扱いにくくなります。

arivis Pro は、大容量の多次元画像データの読み込み、可視化、解析を支援します。研究者がデータを確認しながら解析を進められる環境を提供します。

手作業による解析負担

細胞や構造物の検出、分類、計測を手作業で行うと、作業時間が増え、データ量の拡大に対応しにくくなります。

arivis Pro は、解析工程を組み合わせてワークフロー化・自動化できます。AI を利用したセグメンテーションなども活用し、解析作業の効率化を支援します。

画像ごとの条件差への対応

標本や撮影条件によって画像の見え方が異なり、単一の解析手法では期待どおりの結果が得られない場合があります。

arivis Pro は、従来手法や AIモデルなどを組み合わせ、データや目的に応じた解析フローを構築できます。arivis Cloud では、独自の AIモデル作成を支援します。

解析手順の再現・共有

手順が個人の経験や手作業に依存すると、担当者間で結果を比較しにくく、同じ解析を再実行するのも難しくなります。

解析工程をワークフローとして整理・自動化することで、手順の共有や再利用を支援します。チームでの処理・データ活用には arivis Hub を利用できます。

処理能力・運用規模の拡張

データ数や解析件数が増えると、個別のPCでの処理やデータ管理がボトルネックになることがあります。

arivis Hub は、ローカルやクラウドなどの環境で解析処理を拡張し、並列処理やデータへのアクセス管理を支援します。

ZEISS arivis シリーズ

arivis Pro, arivis Hub, arivis Cloud の使い分け

3つの ZEISS arivis

ZEISS arivis はスケーラブルなソフトウェアツールであり、用途や規模により次の3つのバリエーションをご用意しています。

「arivis Pro」では、従来手法に加え、AIモデルやPythonスクリプトを活用した柔軟な解析パイプラインを構築できます。「arivis Cloud」では、直感的な操作で深層学習モデルをトレーニングし、解析ワークフローに活用できます。さらに、「arivis Hub」では、解析処理の並列化や大規模データへの展開、チームでのデータ共有を支援します。

arivis Pro (画像解析・可視化)

arivis Cloud (AIモデルトレーニング)

arivis Hub (解析処理の拡張・管理)

  • 2D・3D・4D画像の解析・可視化を支援
  • 大容量データを扱い、柔軟な解析ワークフローを構築
  • AIモデルや Pythonスクリプトを活用した解析に対応
  • AI モデルのトレーニングを支援するクラウド環境
  • 直感的な操作で、独自モデルの作成を始めやすい
  • 作成モデルを arivis Pro や ZEN の解析ワークフローに活用可能
  • arivis Pro で作成した解析ワークフロー処理を拡張
  • ローカル、クラウド、ハイブリッド環境での並列処理を支援
  • ブラウザ経由でのデータアクセスやユーザー管理を支援

arivis シリーズ のイメージ図

arivis 活用事例

ZEISS arivis を活用した論文

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