Sistemas de captura de imágenes de biología espacial

Axioscan 7 para biología espacial puede separar 8 canales de fluorescencia, actualmente gracias al uso de reactivos SpectraClick de Kromnigon. Un panel típico podría constar de 7 marcadores diana y DAPI. Entre los fluoróforos compatibles se incluyen DAPI, CFP, GFP, DsRed, Cy3, Cy5, Cy7 y fluoróforos con propiedades espectrales similares. La tinción de fase sencilla y la captura de imágenes de único disparo pueden llevarse a cabo para 8 canales. Para números de marcadores mayores (p. ej. 14, 28, etc.) es posible realizar la tinción y captura de imágenes de modo cíclico.

El sistema es compatible con un gran número de reactivos y fluoróforos recomendados que se emparejan con los conjuntos de filtros incorporados. Cuando se trata de un ensayo optimizado con intensidades de señal compensadas entre canales próximos, la diafonía de los canales es mínima, generalmente de un 4 %. En caso necesario, la segregación espectral integrada puede aplicarse como un paso automatizado de postprocesamiento, con la refinación posterior de la claridad de la señal sin intervención del usuario.

La capacidad física del portaobjetos del sistema es de 100 portaobjetos (25 bandejas de 4 portaobjetos cada una). El sistema puede captar imágenes de más de 100 portaobjetos al día gracias al elevado nivel de automatización y a la alta velocidad de escaneado. El tiempo de escaneado puro de un área de tejido de 10 mm2 oscila entre los 3 y los 10 minutos para 5-plex u 8-plex, respectivamente.

Si usted dispone de Axioscan 7, es posible actualizarlo para conseguir la configuración para biología espacial. No es posible la actualización desde Axioscan Z.1. Para conocer más detalles sobre cómo podemos ayudarle en su transición, póngase en contacto con su equipo de soporte y ventas local de ZEISS.

No, la tinción de anticuerpos se realiza fuera del instrumento. Dependiendo del sistema de ensayo, el panel completo se puede teñir de una sola vez o en diferentes fases, manualmente o utilizando un dispositivo automatizado, antes de proceder al escaneado con el sistema Axioscan 7 para biología espacial.

Sí. Pueden procesarse al mismo tiempo un máximo de 100 portaobjetos, cada uno de los cuales puede incluir múltiples secciones o núcleos de tejido. Los perfiles de escaneado preconfigurados para los tejidos con tinción de los ensayos cromogénicos y mIF pueden seleccionarse en cada una de las muestras, permitiendo a los usuarios cargar y llevar a cabo diversos experimentos en un lote, en un solo flujo de trabajo automatizado.

Recomendamos un grosor de tejido de 2–10 μm para un escaneado óptimo. No obstante, si las secciones son más gruesas, el sistema permite la captura de imágenes z-stack para capturar múltiples planos focales, garantizando una obtención de datos de alta calidad.

El grosor recomendado para obtener resultados óptimos con el algoritmo de análisis de datos es de 2-5 μm. 

No se requiere experiencia previa en microscopía. El software y el escáner han sido diseñados para garantizar un uso sencillo, con una interfaz intuitiva y flujos de trabajo automatizados que permiten que cualquier operador utilice el sistema de manera eficiente, con muy poca formación o ninguna.

El sistema incluye una biblioteca de perfiles de escaneado previamente optimizados para ensayos de proveedores de reactivos compatibles, que se almacenan en su base de datos. Al integrarse con el LIMS del usuario o el sistema de registro del laboratorio, Axioscan recupera automáticamente la información de la muestra, incluyendo el tipo de ensayo, y aplica el perfil de escaneado apropiado prescindiendo de la configuración manual y sin necesidad de formación específica.

Sí. SlideStream cuenta con una función simplificada para configurar ensayos personalizados, lo que permite a los usuarios definir rápidamente y sin complicaciones los ajustes de escaneado y análisis. Esto permite la adaptación flexible a los nuevos ensayos, manteniendo un flujo de trabajo eficiente y fácil de usar.

Sí, puede importar un archivo CSV sencillo con los nombres de las muestras y la información sobre el tipo de ensayo y, a continuación, cargarlo en el sistema para utilizarlo sin problemas. Como alternativa, puede introducir manualmente los detalles de la muestra directamente en la interfaz del software y seleccionar el ensayo correspondiente para iniciar el escaneado.

Axioscan 7 y LIMS se conectan escaneando los códigos QR o códigos de barras impresos en las etiquetas de los portaobjetos. El escáner lee el ID unívoco del portaobjetos en el código de la muestra, recupera la información adicional requerida del LIMS y la utiliza para transferir automáticamente los detalles relevantes a la interfaz de SlideStream, permitiendo un flujo de trabajo continuado y eliminando el esfuerzo de volver a introducir manualmente los datos ya existentes.

Para un rendimiento óptimo, recomendamos utilizar la última versión de Google Chrome, una conexión a internet estable con al menos 10 Mbps de ancho de banda y un ordenador con sistema operativo actualizado. Estos requisitos garantizan un funcionamiento continuado y responsivo de la plataforma.

A través del flujo de trabajo de SlideStream, las imágenes se cargan automáticamente a la instancia del servidor en la nube específico del cliente en cuanto finaliza el escaneado. Una vez cargadas, se encuentran disponibles inmediatamente para su revisión en el IMS de mIF. Se requiere una conexión a internet activa para que el escáner pueda transferir los datos de forma ininterrumpida.

No, el IMS está basado en navegador y exige el uso de un navegador para acceder a su interfaz. No obstante, es posible instalar una opción local independiente de la nube que utilice el navegador pero que funcione completamente dentro de la red del cliente. En este caso, nuestros modelos de IA dockerizados se instalan en las instalaciones del cliente, garantizando que los datos de los resultados y las imágenes permanezcan íntegramente dentro de la infraestructura local. Póngase en contacto con nosotros para comentar los detalles del proceso.

En estos momentos no hay disponible una versión autónoma sin ZEISS SlideStream. Sin embargo, estamos estudiando esta opción. Mientras tanto, le ofrecemos opciones de integración personalizadas con plataformas de IMS existentes. Estas comprenden desde integraciones superficiales que muestran los resultados en una ventana independiente del navegador de IMS de Mindpeak, hasta integraciones profundas en las que los resultados se incrustan directamente en visualizadores de IMS de terceros. Gracias a nuestra colaboración con 16 proveedores de IMS, como Paige, Sectra, Philips y Proscia, podemos garantizar la integración ininterrumpida en flujos de trabajo de mIF.

Sí, la implementación local es posible. Para clientes que procesan grandes volúmenes de imágenes o que necesitan almacenar los datos en una memoria local, Mindpeak ofrece opciones de implementación híbrida. En esta configuración, los datos se guardan en el servidor del cliente, mientras que el procesamiento se lleva a cabo en la infraestructura segura de la nube de Mindpeak, ayudando a reducir los costes de almacenamiento y manteniendo un mayor control sobre los datos sensibles.

Las células son detectadas por el modelo fundacional basado en la entrada de contratinción nuclear, p. ej., DAPI y cualquier canal de marcador individual. A diferencia de los métodos no basados en IA, la detección de células se basa en la morfología visible de las células, dando lugar a soluciones muy robustas. Los modelos de IA fundacionales se basan en decenas de miles de imágenes y millones de puntos de datos procedentes de una gran cantidad de marcadores y tipos de tejido diferentes, y permiten la detección de marcadores similares sin formación adicional.

Los límites de almacenamiento están definidos por la infraestructura de TI de los clientes, en función de los paquetes adquiridos. Los clientes tienen la opción de adquirir espacio de almacenamiento adicional en cualquier momento dependiendo de sus necesidades y su presupuesto.

Recomendamos una conexión a internet de 100 Mbit/s o superior, 1 Gbit/s es lo ideal para un rendimiento óptimo, especialmente para trabajar con imágenes grandes o en entornos de múltiples usuarios. Para disfrutar de la mejor experiencia, utilice Google Chrome (versión 120 o superior).

Trabajamos exclusivamente con proveedores de nube que cuentan con la certificación ISO 27001, como AWS y Hetzner, con el fin de garantizar una protección de datos a nivel de empresa. Todos los datos son encriptados tanto en reposo como en tránsito, y se llevan a cabo auditorías de seguridad periódicas para salvaguardar la información sensible de su investigación. Estas medidas garantizan la protección y privacidad de sus datos, sobre los cuales solo usted tiene el control.

• https://d1.awsstatic.com/certifications/iso_27001_global_certification.pdf
• https://www.hetzner.com/assets/downloads/FOX-Zertifikat.pdf