Logiciel

Logiciel de microscopie ZEN

Votre solution complète : de l'échantillon au résultat

ZEN est l'interface utilisateur universelle qui équipe tous les systèmes d'imagerie de ZEISS. Pour les tâches simples et courantes, ZEN vous mène directement au résultat. Pour les expériences de recherche plus complexes, ZEN offre la souplesse nécessaire pour concevoir des processus multidimensionnels adaptés à vos besoins. Quelle que soit la tâche de microscopie à accomplir, vous trouverez des outils et des modules intuitifs pour vous aider :

Capturez des images grâce à une automatisation intelligente
Traitez les images à l'aide d'algorithmes scientifiquement éprouvés
Visualisez des données volumineuses grâce à un moteur 3D alimenté par un processeur graphique (GPU)
Analysez les images grâce à des outils basés sur l'apprentissage automatique
Bénéficiez de la mise en corrélation entre microscopes optiques et électroniques

Smart Acquisition

Réussissez vos expériences les plus complexes

Profitez de la même interface conviviale sur tous vos appareils. Smart Setup, le centre de contrôle intelligent, génère automatiquement les paramètres nécessaires, quel que soit le type de microscope. Vous cherchez à obtenir des expériences reproductibles ? Pour peu que vous disposiez d'une image brute issue d'une précédente acquisition, un simple clic reproduit précisément l'expérience. Vous découvrirez de nombreux autres outils d'automatisation intelligents, notamment pour la détection des événements rares et l'étalonnage du matériel.

Traitement quantitatif

Des résultats fiables et reproductibles

Plus de 180 outils de traitement d'image vous aident à transformer et à gérer vos données. Il suffit de saisir le mot clé de la méthode souhaitée, par exemple kymographe ou déconvolution, pour que ZEN vous y mène directement. ZEN lit les métadonnées de l'image source pour n'afficher ensuite que les étapes logiques du traitement et optimiser automatiquement les paramètres par défaut. Vous pouvez même traiter des images d'autres plateformes à l'aide d'outils d'importation tiers. Dans un espace de travail dédié, traitez facilement des images par lots et obtenez des résultats quantitatifs et fiables.

Visualisation puissante

Interagissez en toute confiance avec vos big data

Générez rapidement un balayage mosaïque en 2D de grande taille et multicanaux à un fort grossissement et effectuez un zoom avant et arrière fluide simplement à l'aide de la souris, comme pour une application de cartographie sur votre smartphone. Vous disposez déjà de 200 Go de données sur le cerveau d'une souris ? Il suffit de les charger dans ZEN : la rapidité et la clarté des différentes méthodes de rendu 3D vous surprendront. Grâce à la technologie arivis ImageCore et à l'utilisation efficace des ressources système, vous pouvez visualiser vos images 3D volumineuses sur du matériel grand public ordinaire.

Analyse sans effort

De nouvelles perspectives sur votre recherche

L'analyse d'image est essentielle pour extraire des informations pertinentes de vos images de microscopie à l'aide d'outils numériques de segmentation et de recalage. Pour ce faire, ZEN propose des outils simples et modulaires, les Bio App. Chaque Bio App est optimisée pour un type d'application, par exemple le comptage cellulaire ou la mesure de la confluence, avec des paramètres de segmentation adaptés et une présentation des données simplifiée. L'assistant du module ZEN Image Analysis vous guide pas à pas pour créer vos mesures uniques.

Microscopie corrélative unique

Combinaison de perspectives entre les différentes échelles et modalités

ZEN superpose, explore et organise vos données multimodales. Vous passez des jours à localiser péniblement les synapses entre deux neurones afin d'obtenir des informations ultrastructurales ? Votre efficacité s'améliorera significativement si vous combinez le grand champ d'observation d'un microscope à fluorescence à champ large et la résolution élevée d'un microscope électronique à émission de champ. ZEN permet de visualiser rapidement la totalité de la coupe contenant les marqueurs fluorescents, en identifiant et déplaçant les régions d'intérêt (ROI) pour l'imagerie EM.

Stockage sécurisé

Gérez vos données complexes en toute confiance

ZEN stocke chacune de vos expériences précieuses avec toutes les métadonnées correspondantes. Le format de fichier .czi est compatible avec Bio-Formats et peut être lu directement par ImageJ et de nombreux autres logiciels tiers. Exportez vos données au format OME-TIFF (Open Microscopy Environment) pour faciliter l'échange de données d'images entre plateformes. Afin de gérer d'énormes volumes de données, ZEN fournit une plateforme centrale basée sur un serveur. Outre le stockage et l'organisation de vos données brutes, vos droits d'accès des utilisateurs y sont gérés. Quant à ZEN Data Explorer, il permet un accès par navigateur depuis n'importe quel appareil.

Nouvelle structure en packs

ZEISS ZEN - Structure des packs ZEN — * Comprend le pack d'acquisition de base ** Pas de fonctions d'acquisition et de contrôle de l'appareil *** Nécessite le pack 2D Toolkit **** Vendu en tant que logiciel autonome

Accès simplifié à d'infinies possibilités

Le logiciel ZEN est une solution complète de bout en bout pour tous les utilisateurs de microscopie. Il évolue sans cesse pour prendre en charge les nouvelles applications en sciences de la vie grâce à des fonctionnalités supplémentaires, par exemple l'acquisition intelligente automatisée, l'analyse intuitive des images et la gestion des données à partir du cloud. Ces capacités avancées accentuent la complexité de l'écosystème ZEN. La version 3.6 de ZEN propose donc des options simplifiées qui améliorent l'accessibilité aux multiples fonctionnalités du logiciel. De nombreux modules ZEN démontrent une grande synergie et leur association est fréquente pour accomplir des tâches spécifiques. À partir de ce principe directeur, nous avons regroupé toutes les puissantes fonctionnalités du logiciel en un ensemble simple de packs d'acquisitions, de boîtes à outils et d'applications adaptés à vos expériences. Les packs permettent de réaliser d'importantes économies par rapport aux modules individuels, ce qui vous permet de rentabiliser votre investissement.

Base
Acquisition d'images de base pour des expériences en time-lapse et en fluorescence multicanaux avec des microscopes manuels, codés et motorisés.

Motorized
Acquisition d'images en fluorescence multicanaux, time-lapse, pile z, balayage mosaïque et expériences multipositions avec mise au point automatique par logiciel, traitement de la profondeur de champ étendue et traitement direct.

Advanced
Acquisition d'images en fluorescence multicanaux, time-lapse, pile z, balayage mosaïque et expériences multipositions et confocales HDR avec mise au point automatique par logiciel, traitement de la profondeur de champ étendue, traitement direct et analyse de la colocalisation.

Smart
Configuration d'expériences d'acquisition inhomogène à l'aide d'une interface utilisateur simple, et acquisition adaptative et automatisée à l'aide d'outils d'analyse d'image ou de script Python.
2D
Utilisation de fonctions avancées de traitement d'images et réalisation d'analyses automatiques d'images 2D guidées par un assistant logiciel intuitif.

3D
Utilisation de fonctions étendues de traitement d'images, visualisation de piles d'images 3D/4D avec des outils de rendu avancés et réalisation d'analyses automatiques d'images 3D guidées par un assistant logiciel intuitif.

Vision4D
Visualisation et analyse de données 3D/4D de taille illimitée grâce aux pipelines flexibles et aux outils d'apprentissage automatique de la plateforme logicielle autonome Vision4D.

AI
Segmentation, classification et débruitage des images à l'aide d'algorithmes d'apprentissage profond accessibles par une interface utilisateur dédiée à l'entraînement des modèles d'IA.

Connect
Acquisition et corrélation d'images provenant de différents instruments tels que des microscopes optiques et électroniques, avec un espace de travail centré sur l'échantillon et un système de gestion de fichiers dédié.

Developer
Personnalisation et automatisation de l'acquisition, du traitement et de l'analyse des images avec un éditeur de script Python dédié à l'enregistrement, au débogage et à la complétion de code.

Molecular Quantification
Acquisition et analyse de la dynamique moléculaire à l'aide de l'imagerie FRAP, FRET et de ratio dans un espace de travail d'analyse dédié utilisant les algorithmes les plus réputés.

Deconvolution
Amélioration intuitive de la résolution des données 2D et 3D jusqu'à 120 nm à l'aide de 15 algorithmes de déconvolution publiés, optimisés par un traitement multi-CPU/multi-GPU efficace.
Bio Apps
Numération cellulaire, mesure de la confluence, détection des taches et expression des gènes et des protéines avec segmentation basée sur l'IA et présentation personnalisée des résultats.

Autres versions ZEN

Téléchargements

ZEN Microscopy Software

Your Complete Solution from Sample to Knowledge

Pages: 32

Taille du fichier: 5 MB

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ZEN Data Storage and Data Explorer

Smart data management in life sciences

Pages: 4

Taille du fichier: 2 MB

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ZEN 3D Toolkit

Visualization and Analysis of 3D Volume Models

Pages: 4

Taille du fichier: 1 MB

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Quick Guide ZEN (blue edition)

Pages: 22

Taille du fichier: 3 MB

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