Logiciel de microscopie ZEN

Notre nouveau chatbot IA intégré dans ZEN est actuellement disponible sur les systèmes LSM et a fait l'objet d'importantes mises à jour :

• Prend en charge diverses versions de ZEN et répond en fonction de la version utilisée
• Prend en compte les capacités distinctes des LSM 910/990
• Offre une meilleure stabilité, également pour les réponses longues
• Prend en compte l'historique de la conversation

L'imagerie grande vitesse Lightfield 4D du LSM a bénéficié de mises à jour importantes :

• Compatibilité Viluma 9 pour une imagerie multicolore rapide et une puissance d'éclairage élevée dans le spectre 500-600 nm
• Taille maximale du tableau de positions augmentée à 1000
• Accélération de Direct Processing d'un facteur deux
• Améliorations de la facilité d'utilisation en traitement Lightfield

Lattice SIM a bénéficié de mises à niveau très attendues en termes de confort d'utilisation :

• Synchronisation automatique de l'objectif sélectionné avec toutes les pistes de l'expérience
• La configuration intelligente permet de définir des noms de colorants dans les pistes

Un certain nombre d'ajouts minimes viennent parfaire cette version :

• Analyse d'images (boîte à outils 2D/3D) : Interface utilisateur améliorée pour la sélection des méthodes de segmentation
• AI Toolkit : Importation améliorée d'images multicanal pour entraîner les modèles de segmentation Intellesis
• Importation de fichiers : L'importateur Glencoe Bioformats a été mis à niveau à la dernière version 8.0.1-761
• LSM : Déconvolution itérative (DCV) pour les images confocales, compatible avec LSM Plus

Les fonctionnalités qui viennent d'être ajoutées à l'acquisition guidée permettent une imagerie précise en time-lapse :

• Passez en boucle une expérience pour trouver de manière dynamique les occurrences rares.
• Créez des enregistrements haute résolution en time-lapse de vos processus biologiques favoris.
• Protégez votre échantillon du blanchiment inutile et évitez les données non nécessaires dans votre espace disque.

Le processus de segmentation par apprentissage profond a reçu d'importantes mises à jour :

• Annotations ultrarapides d'image avec Segment Anything (SAM) sur arivis Cloud
• Gestion simplifiée des modèles avec la nouvelle fonction de filtre dans la bibliothèque de modèles ZEN

La définition des canaux et Smart Setup dans ZEN reposent maintenant sur une nouvelle base de données spectrale :

• La nouvelle base de données contient de nombreux colorants modernes, en particulier pour les protéines fluorescentes génétiquement codées.
• La gestion et la mise à jour de la base de données sont assurées par la communauté scientifique.
• Les spectres antérieurs provenant d'anciennes bases de données restent disponibles.
  

Microscopy Copilot est votre assistant IA personnel. Interactif, il vous aide à découvrir de nouvelles possibilités pour réaliser vos expériences d'imagerie :

• les utilisateurs expérimentés ou novices obtiennent immédiatement des conseils pour optimiser leurs configurations d'acquisition.
• L'assistant conversationnel examine la configuration de votre système LSM.
  

Conçue sur l'algorithme reconnu jDCV et Airyscan Multiplex, cette nouvelle option de traitement fournit une qualité d'image supérieure à une vitesse d'imagerie élevée et est compatible avec Direct Processing et Batch Processing.

Le nouvel algorithme de traitement dédié aux ensembles de données Apotome permet d'obtenir une qualité d'image équivalente à une qualité confocale sur microscopes à champ large :

• Résolution latérale allant jusqu'à 180 nm 
• Résolution axiale améliorée
• Rapport signal/bruit (SNR) amélioré
• Flux de tâches de traitement direct (Direct Processing) et de traitement par lots (Batch Processing) entièrement intégrés dans ZEN
  

Ce nouveau module d'acquisition ZEN permet de bénéficier de la microscopie NLO-FLIM (microscopie d'imagerie en temps de vie de fluorescence optique non linéaire) sur les systèmes ZEISS LSM 980.

• Compatible avec une excitation à ligne simple ou double
• Détection non déscannée NDD à canal simple ou double
  

Ce module élargit les possibilités offertes par ZEN lite, la version gratuite de ZEN dédiée à l'acquisition et à l'analyse basiques d'images, pour vous permettre de contrôler des microscopes dont certains composants sont codés :

• Lecture, affichage et adaptation des configurations de microscope cryptées dans ZEN lite
• Contrôle de la source de lumière LED avec ZEN lite
  

ZEISS Viluma est une gamme de sources de lumière dédiées à l'imagerie de fluorescence qui offre tous les avantages de la technologie LED avancée. L'intégration de nouvelles sources de lumière dans ZEN 3.11 permet de libérer leur potentiel dans l'ensemble de l'écosystème ZEN et de la gamme ZEISS de microscopes à champ large.

La version ZEN 3.11 améliore encore les performances en matière de segmentation d'instances :

• Des résultats plus rapides dans tous les flux de tâches qui incluent la segmentation d'instances
• Des vitesses d'entrainement accélérées
• Un téléchargement de modèle plus rapide entre ZEISS arivis Cloud et ZEN
  

Après avoir optimisé les performances de l'apprentissage profond dans la version précédente, cette version propose désormais également des modèles accélérés. Vous profitez :

• de meilleurs délais d'obtention des résultats pour la segmentation d'instances
• d'une inférence plus rapide dans l'assistant d'analyse d'image, les Bio Apps et les flux de tâches d'acquisition guidée
  

En tant qu'utilisateur de la boîte à outils Bio Apps, vous pouvez désormais analyser la translocation nucléaire des molécules. La nouvelle méthode inclut :

• des configurations simples, en une seule étape
• une vue dédiée aux résultats comprenant des cartes thermiques de plaques de microtitrage
• la possibilité d'intégrer une segmentation avancée d'apprentissage profond
  

La gestion de Lattice SIM a été intégrée tant que caractéristique de Direct Processing. Effectuez des processus de gestion SIM² et profitez :

• d'une amélioration du délai d'obtention des résultats
• d'une augmentation des ressources de calcul grâce au traitement parallèle sur un poste de travail dédié
• d'une compression intelligente des données pour des transferts de fichiers plus rapides
  

Sur les modalités à champ large, les utilisateurs de la boîte à outils IA peuvent désormais utiliser l'apprentissage profond Noise2Void en mode d'acquisition continue. Il permet :

• de réduire efficacement le bruit en direct avec l'algorithme le plus performant de sa catégorie
• d'explorer les échantillons avec des images de qualité dans des conditions d'éclairage modérées
• de réduire la phototoxicité et le blanchiment