Logiciel de microscopie ZEN

Le nouvel algorithme de traitement dédié aux ensembles de données Apotome permet d'obtenir une qualité d'image équivalente à une qualité confocale sur microscopes à champ large :

• Résolution latérale allant jusqu'à 180 nm 
• Résolution axiale améliorée
• Rapport signal/bruit (SNR) amélioré
• Flux de tâches de traitement direct (Direct Processing) et de traitement par lots (Batch Processing) entièrement intégrés dans ZEN
  

Ce nouveau module d'acquisition ZEN permet de bénéficier de la microscopie NLO-FLIM (microscopie d'imagerie en temps de vie de fluorescence optique non linéaire) sur les systèmes ZEISS LSM 980.

• Compatible avec une excitation à ligne simple ou double
• Détection non déscannée NDD à canal simple ou double
  

Ce module élargit les possibilités offertes par ZEN lite, la version gratuite de ZEN dédiée à l'acquisition et à l'analyse basiques d'images, pour vous permettre de contrôler des microscopes dont certains composants sont codés :

• Lecture, affichage et adaptation des configurations de microscope cryptées dans ZEN lite
• Contrôle de la source de lumière LED avec ZEN lite
  

ZEISS Viluma est une gamme de sources de lumière dédiées à l'imagerie de fluorescence qui offre tous les avantages de la technologie LED avancée. L'intégration de nouvelles sources de lumière dans ZEN 3.11 permet de libérer leur potentiel dans l'ensemble de l'écosystème ZEN et de la gamme ZEISS de microscopes à champ large.

La version ZEN 3.11 améliore encore les performances en matière de segmentation d'instances :

• Des résultats plus rapides dans tous les flux de tâches qui incluent la segmentation d'instances
• Des vitesses d'entrainement accélérées
• Un téléchargement de modèle plus rapide entre ZEISS arivis Cloud et ZEN
  

Après avoir optimisé les performances de l'apprentissage profond dans la version précédente, cette version propose désormais également des modèles accélérés. Vous profitez :

• de meilleurs délais d'obtention des résultats pour la segmentation d'instances
• d'une inférence plus rapide dans l'assistant d'analyse d'image, les Bio Apps et les flux de tâches d'acquisition guidée
  

En tant qu'utilisateur de la boîte à outils Bio Apps, vous pouvez désormais analyser la translocation nucléaire des molécules. La nouvelle méthode inclut :

• des configurations simples, en une seule étape
• une vue dédiée aux résultats comprenant des cartes thermiques de plaques de microtitrage
• la possibilité d'intégrer une segmentation avancée d'apprentissage profond
  

La gestion de Lattice SIM a été intégrée tant que caractéristique de Direct Processing. Effectuez des processus de gestion SIM² et profitez :

• d'une amélioration du délai d'obtention des résultats
• d'une augmentation des ressources de calcul grâce au traitement parallèle sur un poste de travail dédié
• d'une compression intelligente des données pour des transferts de fichiers plus rapides
  

Sur les modalités à champ large, les utilisateurs de la boîte à outils IA peuvent désormais utiliser l'apprentissage profond Noise2Void en mode d'acquisition continue. Il permet :

• de réduire efficacement le bruit en direct avec l'algorithme le plus performant de sa catégorie
• d'explorer les échantillons avec des images de qualité dans des conditions d'éclairage modérées
• de réduire la phototoxicité et le blanchiment
  

La fonction de segmentation d'instances a subi d'importantes mises à jour qui amélioreront la qualité de la segmentation et le délai d'obtention des résultats :

• Réduction significative des temps d'apprentissage des modèles
• Modèles de segmentation d'instances multicanale dans ZEN Image Analysis
  
• Coloration aléatoire d'objets pour la visualisation d'objets denses
• Téléchargement à distance de modèles pour les systèmes dont l'accès à l'internet est restreint
  

La compression rapide sans perte avec Zstd est désormais disponible de série pour l'acquisition d'images avec ZEN.

• Grâce à des taux de compression compris entre 2X et 20X, vous bénéficierez de taux de transfert de fichiers rapides et de coûts de stockage de données réduits.
• Pour effectuer très facilement la compression par lots d'archives de données existantes, vous pouvez utiliser notre outil autonome gratuit CZI Shrink
  

Dans cette version, l'outil de traitement direct (Direct Processing) bénéficie des améliorations suivantes :

• Réduction de la charge de calcul de votre système d'acquisition en exécutant le débruitage IA et le démixage linéaire (pour l'imagerie spectrale LSM) sur un poste de travail à distance.
• Direct Processing est désormais compatible avec l'acquisition en mode mixte sur les systèmes LSM et Celldiscoverer 7.
  

Votre imagerie corrélative bénéficie des derniers ajouts de la boîte à outils ZEN Connect :

• Dynamics Profiler est désormais intégré à l'espace de travail Connect.
  
• Des captures d'écran prêtes à être publiées peuvent être créées à partir de données 3D multi-volumes.
  

Simplifiez votre démarrage dans ZEN
Le démarrage de ZEN avec le profil approprié a été encore simplifié. Alors que ZEN se configurait auparavant en fonction des licences disponibles (partiellement complexes), il accède désormais directement aux profils MTB ZEN disponibles.

Des données plus volumineuses. Un traitement plus rapide.
En raison des ensembles de données toujours plus nombreux, le traitement de grandes quantités de données reste un sujet clé pour les utilisateurs de microscopes. La compression sans perte ZSTD peut désormais être définie par défaut pour les acquisitions d'images, ce qui permet d'augmenter les taux de transfert de fichiers et d'optimiser le stockage des données. En outre, les algorithmes de projection d'intensité maximale, d'assemblage de tuiles et de génération de pyramides d'images ont été considérablement accélérés.

Pré-traitement plus rapide et automatisé des images
Direct Processing, l'outil de gestion des flux de tâches de renom, est désormais associé à un nouvel outil. ZEN 3.8 permet d'intégrer l'assemblage directement dans vos processus d'acquisition automatisés, tout en offrant un gain de performance grâce à l'optimisation des algorithmes et au traitement parallèle.

La révolution de la segmentation se poursuit…
La segmentation d'instances est désormais disponible pour les annotations et les formations sur la plateforme cloud d'IA d'arivis. Dans ZEN, l'assistant d'analyse d'image et la boîte à outils Bio Apps sont prêts à intégrer cette nouvelle fonctionnalité d'IA dans vos flux de tâches. La fonction de segmentation d'instances résout le problème de la séparation précise des objets, même s'ils sont très proches les uns des autres, sans recourir à des algorithmes décisifs limités et sujets aux erreurs.

Gagnez en flexibilité d'utilisation et optimisez l'exploitation de vos postes de travail.
L'introduction de licences flottantes pour ZEN et ses packs de boîtes à outils élargissent les possibilités d'utilisation dans votre établissement. Alors que les utilisateurs de ZEN étaient auparavant restreints à un poste de travail particulier, vous n'êtes plus limité et pouvez désormais utiliser les ressources de votre infrastructure avec davantage de flexibilité.

Utilisez tout le potentiel de votre système d'imagerie.
Les taux d'acquisition des systèmes d'imagerie avancés peuvent facilement dépasser les vitesses de stockage des données, limitant ainsi les expériences sur les données volumineuses. ZEN est maintenant équipé d'une compression Zstandard rapide et sans perte. Des taux de compression jusqu'à 20 fois supérieurs accélèrent le stockage des données et optimisent l'économie des données. Zstandard est intégré au module de traitement direct et aux systèmes ZEISS Lattice Lightsheet 7. Il est également disponible en option pour toutes les données au format .czi.

Améliorations des flux de tâches de l'acquisition guidée
Le module d'acquisition guidée a été doté de nouvelles fonctions pour des flux de tâches encore plus complexes dans le domaine de l'imagerie intelligente. Ainsi, il inclut désormais une sélection de classes entièrement développée dans l'assistant d'analyse d'images et permet des ajustements précis sur la quantité d'acquisitions détaillées à effectuer.

L'architecture à modèle ouvert permet l'échange de modèles.
Les outils d'apprentissage profond sont devenus omniprésents dans les logiciels d'analyse d'images, et la gamme de logiciels de ZEISS ne fait pas exception. Pour faciliter l'échange de modèles, ZEN et Vision4D sont compatibles avec les modèles d'apprentissage profond d'APEER et les modèles tiers. Appliquez gratuitement vos modèles préférés dans les flux de tâches déjà établis.